2013年4月,南京地铁S1号线二期土建工程(剩余段)已经主管部门批准建设,即将开工建设。2014年9月26日上午,位于南京市高淳区的地铁S1号线高淳特大桥第一片450吨预制梁顺利架设成功,标志着该工程进入了新的施工生产阶段。2014年11月11日下午4时,南京地铁S1号线二期TA02标项目部率先成功架设全线第一片U形预制梁。2014年11月24日,地铁S1号线二期项目路基部分已完成土方填筑51850方,剩余31000方。2015年8月24日,由中铁四局建筑公司项目部承建的地铁S1号线二期工程的两个最大单体(组合厂房和综合楼)基础施工全部完成,标志着该工程正式进入主体施工关键阶段。